目前尚未有證據顯示藥物或其它療法能根治自閉症的社交及溝通困難。現時最有效的治療方法，主要是從教育及行為訓練著手，幫助他們建立有效的社交溝通及情緒管理技巧，從而加強他們適應學校生活的能力。 被診斷患有自閉症譜系障礙的兒童，專業評估人員會按其年齡及需要來安排合適的支援服務。年齡介乎二至五歲的學童，可安排輪候社會福利署轄下的早期教育及訓練中心(EETC/E位)，到校學前康復服務(OPRS/O位)或幼稚園暨幼兒中心兼收弱能兒童計劃(ICCC/ I位) 接受訓練，而有進一步需要的可安排入讀特殊幼兒中心(SCCC/S位)。至於學齡兒童，則可通過學校向教育局申撥資源在校推行有關行為管理、溝通及社交技巧訓練等課程。 至於藥物的應用，其目的是主要為舒緩患者的精神或行為症狀，如攻擊或自殘行為，所有藥物應由醫生處方。暫時有兩款獲得美國食品藥品監督管理局(FDA)批準的相關藥物﹕Risperidone 及 Aripiprazole。 至於輔助療法，大部份仍有待確認，未能應用於臨床治療。根據FDA 的資料，以下治療方法對自閉症沒有臨床幫助，甚至可能有害： (x) 去重金屬